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Das Fachgebiet Wassertechnologie kooperiert eng mit der Geschäftsstelle Höxter des Westfälischen Umwelt Zentrums (WUZ), für das die Funktionen des Geschäftsstellenleiters und eines Fachleiters wahrgenommen werden.

Auf dem Gebiet der Charakterisierung natürlicher Wasserinhaltsstoffe besteht eine Kooperation mit dem Norwegischen Institut für Wasserforschung.

Daneben ist das Fachgebiet aktiv beteiligt am Forschungsschwerpunkt "Nachhaltige Wasserwirtschaft und vorsorgender Gewässerschutz".

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